تتعاون شركة بروتون وتتعاون مع عدد من الشركاء الموثوقين والمستدامين محليًا وإقليميًا ودوليًا للحصول على مدخلات ومخرجات أفضل. هؤلاء الشركاء هم شبكة مهنية، ووكالات خاصة وحكومية، ومستشارين حيويين، ومنظمات غير حكومية، ومنظمات مجتمعية، وتعاونيات، ومراكز شبابية، وجامعات ومعاهد تعليمية، ومراكز بحث وتدريب، وأفراد مبتكرين ورواد أعمال.